qPCR结果呈现作图 GraphPad制图手把手教学
当我们处理完qpcr数据,该怎么作图呈现结果呢
假设我们有一组模拟数据,是计算好的表达差异数值
先把他们整理成这个样子会比较方便作图,不整理的话,也可以直接粘贴到作图软件。
首先我们要有GraphPad这个软件,很多学校都是有合作的,可以直接下载使用。我们打开这个软件,会弹出下面这个窗口。像处理这种qPCR几种不同处理对多个基因影响的数据可以选第三个类别,然后选项这里选一下重复数,每个样本做了几个重复,这里就选多少。我们的示例是三个重复的,这里选一下3。
创建以后看到一个空白的表格,我们按下图指示输入名称。
然后把数字填进去。
可以在左边栏右键重命名数据表,然后点击下方红框的部分数据1,就可以生成图表。
这时候会弹出一个新的窗口,可以选择图表的类型,一般这种多基因的,可以选择第一或者第二个。
点击确认以后,就会生成一个非常简陋的图表,我们要对它做一些调整和美化。
首先是编辑好横纵坐标的名字,横坐标也可以去掉,只写标题即可。然后鼠标拉一下框选所有文字,调整一下字体的大小和样式,让整体看起来更整齐。文字都可以移动调整位置,用鼠标拖动即可。
接下来我们调整柱子的颜色,如果是毕业论文,后面不想彩印可以保持黑白配色,如果要投稿期刊,我们可以调整到彩色。
调整外观,填充改一个颜色,边框调整为无
确认后,就会把这个柱子同一组的柱子颜色都改好了。
依次改好,就可以得到一个比较和谐的图片。这样就基本完成了。
如果想要黑白的,又不想只有纯色,可以选一下花纹。勾选填充样式,注意分清花纹色和背景色。
然后我们还可以做一些调整,双击一个柱子,选择更改图表类型。
可以在这里调整error bar的呈现方式,可以呈现标准偏差(Standard Deviation,SD)或者标准误差(Standard Error,SE\Standard Error of Mean, SEM)。也可以在这里重新选择图表的样式,改变图表呈现的形式。比如说: